UbuntuRAxML

Ubuntu Linux 13.04上でRAxML 7.4.2

用意するもの

• RAxMLのソースファイル
  • https://github.com/stamatak/standard-RAxML でzip形式で入手可能．
• gccなど

コンパイル

• 端末上でコンパイル
  • make -f Makefile.SSE3.PTHREADS.gcc
• できたファイルを/usr/local/bin/などに移動しておく．

気づき

• Kakusan4をインストールすると，同時にコンパイルされる．
  • UbuntuKakusan4
• 2013年5月17日現在，Version 7.5.3．

プログラムの動作

• /usr/local/bin/raxmlHPC742-PTHREADS-SSE3

The number of threads is currently set to 0
Specify the number of threads to run via -T numberOfThreads
NumberOfThreads must be set to an integer value greater than 1