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坪田博美 Hiromi TSUBOTA

  • 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所
  • Miyajima Natural Botanical Garden, Graduate School of Science, Hiroshima University

研究内容

  • 蘚苔類（コケ植物）の系統・分類学・植物地理学的研究
  • 広島県を中心とした瀬戸内地域のフロラ
  • 宮島を中心とした森林遷移に関関する基礎研究
  • 淡水藻類・気生藻類の系統・分類学的研究
  • 帰化植物
  • 絶滅危惧種
  • DNAバーコーディング

インターネットリソース

研究業績

業績リスト

論文・総説等

  1. 坪田博美・関 太郎. 1996. 広島県上蒲刈島を中心とした蘚苔類の種数-面積関係. 蘚苔類学会会報 6: 255-256.
  2. Tsubota, H., N. Nakao, T. Arikawa, T. Yamaguchi, M. Higuchi, H. Deguchi & T. Seki. 1999. A preliminary phylogeny of Hypnales (Musci) as inferred from chloroplast rbcL sequence data. Bryological Research 7: 233-248.
  3. 向井誠二・坪田博美・中原美保・関太郎・豊原源太郎・出口博則. 1999. 広島県におけるモロコシソウ（Lysimachia sikokiana Miq.）の現状とその保護について. Hikobia 13: 31-34.
  4. De Luna, E., W. R. Buck, H. Akiyama, T. Arikawa, H. Tsubota, D. Gonzalez, A. E. Newton & A. J. Shaw. 2000. Ordinal phylogeny within the hypnobryalean pleurocarpous mosses inferred from cladistic analyses of three chloroplast DNA sequence data sets: trnL-F, rps4, and rbcL. Bryologist 103: 242-256.
  5. Tsubota, H., N. Nakao, T. Yamaguchi, T. Seki & H. Deguchi. 2000. Preliminary phylogenetic relationships of the genus Brotherella and its allied genera (Hypnales, Musci) based on chloroplast rbcL sequence data. Journal of Hattori Botanical Laboratory 88: 79-99.
  6. Akiyama, H. & Tsubota, H. 2001. Pseudotrismegistia H. Akiy. & Tsubota, a new genus of the Sematophyllaceae (Musci). Acta Phytotax. Geobot. 52: 85-95. 和文要旨
  7. Tsubota, H., H. Akiyama, T. Yamaguchi & H. Deguchi. 2001. Molecular phylogeny of the genus Trismegistia and related genera (Sematophyllaceae, Musci) based on chloroplast rbcL sequences. Hikobia 13: 529-549.
  8. Tsubota, H., H. Akiyama, T. Yamaguchi & H. Deguchi. 2001. Molecular phylogeny of the Sematophyllaceae (Hypnales, Musci) based on chloroplast rbcL sequences. J. Hattori Bot. Lab. 90: 221-240.
  9. 坪田博美・有川智己・中尾成身. 2001. 分子系統学のための蘚苔類からのDNA抽出法. 蘚苔類研究 8: 9-17.
  10. Estebanez, B., H. Tsubota, T. Yamaguchi & H. Deguchi. 2002. Histochemical observations on the peristome of several haplolepidous mosses. Hikobia 13(4): 667-677.
  11. Tsubota, H., T. Arikawa, H. Akiyama, E. De Luna, D. Gonzalez, M. Higuchi & H. Deguchi. 2002. Molecular phylogeny of hypnobryalean mosses as inferred from a large-scale dataset of chloroplast rbcL, with special reference to the Hypnaceae and possibly related families. Hikobia 13: 645-665.
  12. 坪田博美・松田秀隆・Haji Mohamed・出口博則. 2002. 小型苔類からのDNA抽出法. 蘚苔類研究 8: 118-122.
  13. Akiyama, H., H. Tsubota, T. Yamaguchi & M. Suleiman. 2003. The new genus Benitotania (Daltoniaceae, Bryopsida) from Mt. Kinabalu. Bryologist 106(3): 454-459.
  14. Handa, S., Nakahara, M., Tsubota, H., Deguchi, H. & Nakano, T. 2003. A new aerial alga, Stichococcus ampulliformis sp. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) from Japan. Phycol. Res. 51: 203-210.
  15. Oguri, E., T. Yamaguchi, H. Tsubota & H. Deguchi. 2003. A preliminary phylogenic study of the genus Leucobryum (Leucobryaceae, Musci) in Asia and the Pacific based on ITS and rbcL sequences. Hikobia 14: 45-53.
  16. Tsubota, H., Y. Ageno, B. Estebanez, T. Yamaguchi & H. Deguchi. 2003. Molecular phylogeny of the Grimmiales (Musci) based on chloroplast rbcL sequences. Hikobia 14: 55-70.
  17. Akiyama, H. & H. Tsubota. 2004. Morphological and genetical variations and familial affinity of the genus Dixonia (Musci). Bryological Research 8: 229-237.
  18. Nakahara, M., H. Tsubota, S. Handa, S. Watanabe & H. Deguchi. 2004. Molecular phylogeny of Chlorella-like symbiotic algae in Paramecium bursaria based on 18S rRNA gene sequences. Hikobia 14: 129-142.
  19. Sato, H., H. Tsubota, T. Yamaguchi & H. Deguchi. 2004. Phylogenetic and morphological notes on Uleobryum naganoi Kiguchi et al. (Pottiaceae, Musci). Hikobia 14: 143-147.
  20. Tsubota, H., E. De Luna, D. Gonzalez, M. S. Ignatov & H. Deguchi. 2004. Molecular phylogenetic and ordinal relationships based on analyses of a large-scale data set of 600 rbcL sequences of mosses. [[Hikobia>http://home.hiroshima-u.ac.jp/hikobia/]] 14: 149-169.
  21. Yano, O., T. Katsuyama, H. Tsubota & T. Hoshino. 2004. Molecular phylogeny of Japanese Eleocharis (Cyperaceae) based on ITS sequence data, and chromosomal evolution. J. Plant Res. 117: 409-419.
  22. Tsubota, H., K. Takahashi, M. Nakahara, H. Mohamed & H. Deguchi. 2005. A simple procedure for DNA isolation using small quantities of lichen thallus. Lichenology 4: 25-28. [坪田博美・高橋奏恵・中原美保・H. Mohamed・出口博則: 少量の地衣体からのDNA簡易抽出法]
  23. 坪田博美・加藤研治・出口博則. 2005. 「コケ文献データベース-日本関係分-」用簡易データベース検索プログラムについて. 蘚苔類研究 8: 354-360. [Tsubota, H., K. Kato & H. Deguchi. 2005. KOKE-SEARCH: A database search program package for literature relevant to Japanese bryophytes. Bryol. Res. 8: 354-360.]
  24. 坪田博美・向井誠二・山口富美夫・豊原源太郎・出口博則. 2005. 研究資料の電子化とインターネット上での公開について. Hikobia 14: 345-349.
  25. 半田信司・中原美保・坪田博美・中野武登. 2005. 日本新産の気生藻類ミノスミレモTrentepohlia arborum (Agardh) Hariot（スミレモ科，アオサ藻綱）. Hikobia 14: 339-343.
  26. Arikawa, T., H. Tsubota & M. Higuchi. 2006. A reappraisal of Pylaisiopsis (Sematophyllaceae). Bryologist 109 (3): 381-390.
  27. Handa, S., M. Nakahara, H. Tsubota, H. Deguchi, Y. Masuda & T. Nakano. 2006. Choricystis minor (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) as a symbiont of several species of freshwater sponge. Hikobia 14: 365-373.
  28. Oguri, E., T. Yamaguchi, H. Tsubota, M. Shimamura M. & H. Deguchi. 2006. Morphological and molecular analyses to solve a taxonomical controversy of Leucobryum juniperoideum (Brid.) Mull.Hal. and L. humillimum Cardot (Leucobryaceae, Musci) in Japan. Hikobia 14: 387-398.
  29. Takahashi, K., L.-S. Wang, H. Tsubota & H. Deguchi. 2006. Photosymbiodemes Sticta wrightii and Dendriscocaulon sp. (lichenized ascomycota) from Yunnan, China. J. Hattori Bot. Lab. 100: 783-796.
  30. Tsubota, H., A. Kuroda, H. Masuzaki, M. Nakahara & H. Deguchi. 2006. A preliminary study on allelopathic activity of bryophytes under laboratory conditions using the sandwich method. J. Hattori Bot. Lab. 100: 517-525.
  31. Afonina, O. M., H. Tsubota & Ignatova, E. A. 2007 (2008). The genus Pylaisiadelpha (Pylaisiadelphaceae, Musci) in Russia. Arctoa 16: 127-132.
  32. Ozeki, M., Y. Isagi, H. Tsubota, P. Jacklyn & D. M. J. S. Bowman. 2007. Phylogeography of an Australian termite, Amitermes laurensis (Isoptera, Termitidae), with special reference to the variety of mound shapes. Mol. Phyl. Evol. 42: 236-247.
  33. 園山和志・徳納真高・坪田博美・山口富美夫・若杉孝生・出口博則. 2007. 平泉寺およびその周辺地域における蘚苔類フロラの研究. 福井総合植物園紀要 5: 1-20.
  34. 向井誠二・坪田博美・澤田つや子・北本照子・吉野由紀夫・関 太郎. 2007. 宮島におけるシロシャクジョウBurmannia cryptopetala Makinoの発見. Hikobia 15: 61-66.
  35. Arikawa, T., Tsubota, H., Deguchi, H., Nishimura, N. & Higuchi, M. 2008(2009). Phylogenetic analysis of the family Hypnaceae based on rbcL gene sequences. In Mohamed, H., Baki, B. B., Nasrulhaq-Boyce, A. & Lee P. K. Y. (eds.) Bryology in the New Milenium, pp. 215-225. University of Malaya, Kuala Lumpur.
  36. Oguri, E., T. Yamaguchi, M. Shimamura, H. Tsubota & H. Deguchi. 2008. Phylogenetic and morphological reevaluation of Leucobryum boninense (Leucobryaceae), endemic to the Bonin Islands. Bryologist 111(2): 260-270.
  37. 久保晴盛・長谷信二・坪田博美. 2008. 広島県におけるアオモジ（クスノキ科）の分布と生育環境および侵入生物種としての現状と定着要因. Hikobia 15(2): 217-224.
  38. 半田信司・関 太郎・向井誠二・坪田博美. 2008. 宮島におけるイカリソウ属の一種Epimedium sp. の再確認. Hikobia 15(2): 225-230.
  39. Akiyama, H. & Tsubota, H. 2009. Symphyodon leiocarpus, sp. nov. (Symphyodontaceae, Musci) from Thailand, classified in the new subgenus Macrothamniopsis. Acta Phytotax. Geobot. 60: 28-37.
  40. 金丸純二・坪田博美・向井誠二・岡芳香・石原直久・小早川喜伸・加藤秀雄・長野由知・中尾佳行. 2009. 確かな学力の育成 ―世界遺産宮島から学ぶ野外教育実践―. 広島大学学部・附属学校共同研究機構研究紀要 37: 201-204.
  41. 古本 強・坪田博美・植木龍也・三浦郁夫. 2009. 社会実践生物学とブレインストーミング実習, 発想力と実践力をいかにして伸ばすか. 生物工学 87: 343-347.
  42. 坪田博美・久保晴盛・向井誠二. 2009. 広島県宮島近海で見つかったヤマトウミヒルモHalophila nipponica J.Kuoについて. Hikobia 15: 339-347. [Tsubota, H., Kubo, H. & Mukai, S. 2009. A new finding of seagrass Halophila nipponica J.Kuo (Hydrocharitaceae) from Miyajima Island in Hiroshima Prefecture, SW Japan. Hikobia 15: 339-347 (in Japanese with English Abstract and Tables).]
  43. Masuzaki, H., Shimamura, M., Furuki, T., Tsubota, H., Yamaguchi, T., Haji Mohamed Abdul Majid & Deguchi, H. 2010. Systematic position of the enigmatic liverwort Mizutania (Mizutaniaceae, Marchantiophyta) inferred from molecular phylogenetic analyses. Taxon 59 (2): 448-458.
  44. Masuzaki, H., Tsubota, H., Shimamura, M., Yamaguchi, T. & Deguchi, H. 2010. A taxonomic revision of the genus Apometzgeria (Metzgeriaceae, Marchantiophyta). Hikobia 15: 427–452.
  45. Oguri, E., Yamaguchi, T., Tsubota, H., Shimamura, M. & Deguchi, H. 2010. Phylogenetic relationships among Leucobryum juniperoideum and related species (Leucobryaceae, Musci) inferred from ITS sequences. Hikobia 15: 453–462.
  46. 久保晴盛・向井誠二・坪田博美. 2010. ヒコビア植物観察会の500回までのあゆみと広島県普通植物分布図. Hikobia 15: 511–522. [with English abstract]
  47. 宮里智恵・坪田博美・金丸純二・岡芳香・向井誠二・加藤秀雄・石原直久・天野弥生・鈴木克周・中尾佳行. 2010. 確かな学力の育成 ―世界遺産宮島から学ぶ野外教育実践（2009年度）―. 広島大学学部・附属学校共同研究機構研究紀要 38: 223-227.
  48. 世羅徹哉・坪田博美・松井健一・浜田展也・吉野由紀夫. 2010. 広島県植物誌補遺. 広島市植物公園紀要 28: 1-74. [with English summary]
  49. 平原友紀・久保晴盛・木村茉南美・向井誠二・坪田博美. 2010. 広島県植物誌（1997）以降に広島県廿日市市宮島から報告された種子植物. 広島大学総合博物館研究報告 2: 57–63. [with English summary] (pdf版)
  50. Inoue, Y., Tsubota, H., Kubo, H., Uchida, S., Mukai, S., Shimamura, M. & Deguchi, H. 2011. A note on Pottia intermedia (Turner) Fürnr. (Pottiaceae, Bryopsida) with special reference to its phylogeny and new localities in SW Japan. Hikobia 16(1): 67-78.
  51. Kuroda, A., Tsubota, H., Mukai, S., Toyohara, G. & Itani, T. 2011. A preliminary study of allelopathic activity of evergreen perennial ferns, Dicranopteris linearis and Gleichenia japonica (Gleicheniaceae), based on laboratory bioassays using lettuce seeds. Hikobia 16(1): 1-7.
  52. Masuzaki, H., Furuki, T., Dalton, P. J., Tsubota, H., Seppelt, R. D. & Deguchi, H. 2011. The phylogenetic position of Vandiemenia ratkowskiana (Metzgeriales, Marchantiophyta). Hikobia 16(1): 51-57.
  53. 宮里智恵， 坪田博美， 長野由知ほか. 2011. 確かな学力の育成--世界遺産宮島から学ぶ野外教育実践 (2010 年度). 広島大学学部・附属学校共同研究紀要, 325-329.
  54. Inoue, Y., Tsubota, H., Sato, H. & Yamaguchi, T. 2012. Phylogenetic note on Pachyneuropsis miyagii T.Yamag. (Pottiaceae, Bryophyta). Hikobia 16(2): 221-228.
  55. Oguri, E., Yamaguchi, T., Tsubota, H., Deguchi, H. & Murakami, N. 2012. Genetic differentiation between Dendroceros japonicus and D. tubercularis in Japan. Hikobia 16(2): 215-220.
  56. Shimamura, M., Itouga, M. & Tsubota, H. 2012. Evolution of apolar sporocytes in marchantialean liverworts: implications from molecular phylogeny. J. Plant Res.125: 197–206.
  57. 井上侑哉・立石幸敏・片桐知之・坪田博美. 2012. Trichocolea japonica（新称：イボイボムクムクゴケ）の新産地. 蘚苔類研究 10: 291-292.
  58. 久保晴盛・井上侑哉・長谷信二・坪田博美. 2012. ニセツリガネゴケが広島県で見つかる. 蘚苔類研究 10(7): 228-229. [Kubo, H., Inoue, Y., Nagatani, S. & Tsubota, H. 2012. Physcomitrella patens (Hedw.) Bruch & Schimp. subsp. californica (H. A. Crum & L. E. Anderson) B. C. Tan new to Hiroshima Prefecture, SW Japan. Bryol. Res. 10(7): 228-229.]
  59. 宮里智恵・坪田博美・石井信孝・安松洋佳・小早川善伸・田野賢一・渕山真悟・内田慎治・向井誠二・金丸純二. 2012. 確かな学力の育成と評価の在り方 ―世界遺産宮島から学ぶ野外教育実践（2011年度）―. 広島大学学部・附属学校共同研究機構研究紀要 40: 99–104.
  60. 坪田博美・吉野奈津子・西田佐知子. 2012. 名古屋大学博物館野外観察園の蘚類 (予報). 名古屋大学博物館報告 28: 129-132.
  61. 坪田博美・久保晴盛・武内一恵・中原-坪田美保・井上侑哉・内田慎治・向井誠二. 2012. 広島の帰化植物3. トゲヂシャとマルバトゲヂシャ. Hikobia 16(2): 197-202. [Tsubota, H., Kubo, H., Takeuchi, K., Nakahara-Tsubota, M., Inoue, Y., Uchida, S. & Mukai, S. 2012. Notes on naturalized plants in Hiroshima Prefecture: 3. New locality and nrITS variation of Lactuca serriola L. (Asteraceae). Hikobia 16: 197-202 (in Japanese with English Abstract and Tables).]
  62. 内田慎治・井上侑哉・向井誠二・坪田博美. 2012. 広島県宮島におけるウエマツソウSciaphila secundiflora Thwaites ex Benth.（ホンゴウソウ科Triuridaceae）の発見. Hikobia 16(2): 193-196.
  63. Inoue, Y., Uchida, S. & Tsubota, H. 2013. Notes on rhizoidal tubers in Tortula truncata (Pottiaceae, Bryophyta) from Japan. Hikobia 16: 299-302.
  64. Katagiri, T., Sadamitsu, A., Miyauchi, H., Tsubota, H. & Deguchi, H. 2013. Taxonomic studies of the Trichocoleaceae in Southeast Asia. III. The genus Trichocolea Dumort. Hattoria 4: 1-42.
  65. Oguri, E., Yamaguchi, T., Tsubota, H., Deguchi, H. & Murakami, N. 2013. Geographical origin of Leucobryum boninense Sull. & Lesq. (Leucobryaceae, Musci) endemic to the Bonin Islands, Japan. Ecol. Evol. 3(4): 753-762. doi: 10.1002/ece3.492. pdf
  66. Suzuki, T., Inoue, Y., Tsubota, H. & Iwatsuki, Z. 2013. Notes on Aptychella (Sematophyllaceae, Bryopsida): Yakushimabryum longissimum, syn. nov. Hattoria 4: 107-118.
  67. 井上侑哉・立石幸敏・坪田博美. 2013. コモチネジレゴケが長野県で見つかる. 蘚苔類研究 10(12): 420.
  68. 坪田博美・久保晴盛・大野彰洋・井上侑哉・中原-坪田美保・武内一恵・松井健一・内田慎治・向井誠二. 2013. 広島の帰化植物4．イヌカキネガラシおよびその近縁種. Hikobia 16: 321-334. [Tsubota, H., Kubo, H., Ohno, A., Inoue, Y., Nakahara-Tsubota, M., Takeuchi, K., Matsui, K., Uchida, S. & Mukai, S. 2013. Notes on naturalized plants in Hiroshima Prefecture: 4. New locality and phylogeny of Sisymbrium orientale L. (Brassicaceae) and its related species. Hikobia 16: 321-334.]
  69. Aoyama, M. & Tsubota, H. 2014. Karyotype analysis of Japanese Burmannia (Burmanniaceae). Acta Phytotax. Geobot. 65(1): 37-42.
  70. 坪田博美. 2014. 宮島の自然－その現状と課題－. 厳島研究 10: (1)-(18).
  71. 半田信司・正田いずみ・溝渕 綾・中原-坪田美保・坪田博美． 2014. 日本新産の気生藻類ミルイロスミレモTrentepohlia bosseae var. samoensis（スミレモ科，アオサ藻綱）. 植物研究雑誌 89: 59-64. [Handa, S., Shoda, I. Mizobuchi, A, Nakahara-Tsubota, M. & Tsubota, H. 2014. Trentepohlia bosseae var. samoensis (Trentepohliaceae, Ulvophyceae), an aerial alga newly found in Japan. J. Jpn. Bot. 89: 59-64. (in Japanese with English abstract)]
  72. 井上侑哉・長谷信二・坪田博美. 2014. センボンウリゴケ（センボンゴケ科，蘚類）の新産地と日本国内での分布. 植物研究雑誌 89(3): 189-192. [Inoue, Y., Nagatani, S. & Tsubota, H. 2014. New localities of Timmiella anomala (Pottiaceae, Bryophyta) and its distribution in Japan. J. Jpn. Bot. 89: 189-192. (in Japanese with English abstract)]
  73. Suzuki, T., Inoue, Y. & Tsubota, H. 2014. Notes on Clastobryella tenella and Gammiella ceylonensis (Sematophyllaceae, Bryopsida) in Japan. Hattoria 5: 101-113.
  74. Inoue, Y. & Tsubota, H. 2014. On the systematic position of the genus Timmiella (Dicranidae, Bryopsida) and its allied genera, with the description of a new family Timmiellaceae. Phytotaxa 181(3): 151–162.
  75. 坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保・島本俊樹・松田伊代・内田慎治・向井誠二. 2014. 標本同定のツールとしてのDNAバーコーディングと分子系統解析－広島県宮島で採集された標本の例－. Hikobia 16: 475-490. [Tsubota, H., Inoue, Y., Nakahara-Tsubota, M., Shimamoto, T., Matsuda, I., Uchida, S. & Mukai, S. 2014. Combination of DNA barcoding and molecular phylogenetic analysis as an identification tool for plant species: a case study using imperfect herbarium specimens. Hikobia 16: 475-490 (in Japanese with English Abstract and Tables).]
  76. 坪田博美・中原-坪田美保・井上侑哉・内田慎治・向井誠二. 2014. 広島の帰化植物5．ヒメムラサキハナナ. Hikobia 16: 491-497.[Tsubota, H., Nakahara-Tsubota, M., Inoue, Y., Uchida, S. & Mukai, S. 2014. Notes on naturalized plants in Hiroshima Prefecture: 5. New locality and phylogeny of Ionopsidium acaule (Desf.) DC. ex Rchb. (Brassicaceae). Hikobia 16: 491-497 (in Japanese with English Abstract and Tables).]
  77. 山内大輝・丸山隼人・内田慎治・向井誠二・坪田博美・和崎 淳. 2015. 日本産ヤマモガシ（ヤマモガシ科）のクラスター根の発見. 植物研究雑誌 90(2): 103-108.
  78. 坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保・内田慎治・向井誠二. 2014 (2015). 標本同定のツールとしてのDNAバーコーディング－植物標本の例－. 広島大学総合博物館研究報告 6: 41-49.
  79. Suzuki, Y., Takenaka, C., Tomioka, R., Tsubota, H., Takasaki, Y. & Umemura, T. 2015. Accumulation of arsenic and copper by bryophytes growing in an aquatic environment near copper mine tailings. Mine Water Environ. online published 04 Apr 2015.
  80. 坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保. 2015. 考古資料に対するDNAバーコーディングの可能性. 厳島研究 11: (13)-(23).
  81. 井上侑哉・坪田博美. 2015. 蘚類センボンウリゴケ属の帰属に関する最近の知見とセンボンウリゴケ科（新称）の提案. 蘚苔類研究 11(4): 115-116.
  82. Suzuki, T., Inoue, Y. & Tsubota, H. 2015. Diphyscium (Diphysciaceae, Bryopsida) species newly found in Japan. Hattoria 6: 63-73.

著書・報告書等

  1. 坪田博美・山口富美夫・出口博則・関太郎. 1997年12月. コケ植物目録. 広島大学理学部附属宮島自然植物実験所・比婆科学教育振興会（編）, 広島県植物誌, 613-655 pp. 中国新聞社, 広島.
  2. 坪田博美・有川智己. 2003. 分子系統解析法. 日本蘚苔類学会記念出版物編集委員会(編), コケ類研究の手引き, 79-88 pp.
  3. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所（坪田博美・向井誠二）（編）. 2007. 宮島の植物と自然（配布版）. 104 pp. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所, 廿日市市.
  4. 海堀正博・関 太郎・鈴木盛久・北川隆司・奥田敏統・出口博則・坪田博美. 2008. 保護されたエリアでの山腹崩壊発生地における自然環境の再生に関する研究. 砂防・地すべり技術センター（編）, 平成20年度砂防地すべり技術研究成果報告会講演論文集, 29–51 pp. 砂防・地すべり技術センター, 東京.
  5. 坪田博美・向井誠二・豊原源太郎. 2008. 植物と植生. 廿日市商工会議所（編）, 宮島本改訂版, 208–225 pp. 廿日市商工会議所, 廿日市.
  6. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所（坪田博美・向井誠二）（編）. 2009. 宮島の植物と自然, 改訂版（8版）. 160 pp. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所, 廿日市市.
  7. 坪田博美・有川智己. 2011. 新・分子系統解析法. 日本蘚苔類学会創立40周年記念出版委員会（編）, 改訂新版・コケ類研究の手引き, 69-82 pp. 日本蘚苔類学会, 東広島. [Tsubota, H. & Arikiawa, T. 2011. Molecular phylogenetic inference. In Furuki, T., H. Akiyama, T. Arikawa & M. Itouga, Methids in Bryological Research, newly revised edition, 69-82 pp. The Bryological Society of Japan, Higashi-hiroshima.]
  8. 坪田博美. 2012. コケ植物の分子系統. In 日本植物分類学会（監修）, 戸部博・田村実（編著）, 新しい植物分類学II, 22-33 pp. 講談社, 東京.

短報・解説

  1. 坪田博美・向井誠二. 2008. 表紙の植物 -トサムラサキについて-. 宮島自然植物実験所ニュースレター 12: 1, 11-14.
  2. 坪田博美・長谷信二・向井誠二・出口博則. 2008. 宮島のこけ2. ウロコゼニゴケ. 宮島自然植物実験所ニュースレター 13: 10-12.
  3. 久保晴盛･長谷信二･武内一恵･坪田博美. 2010. 広島県の帰化植物1. セイタカハハコグサ. 宮島自然植物実験所ニュースレター 15: 11-12.
  4. 坪田博美・久保晴盛・向井誠二. 2010. ヤマトウミヒルモHalophila nipponica J.Kuo（トチカガミ科 Hydrocharitaceae）. 宮島自然植物実験所ニュースレター 17: 1.
  5. 久保晴盛・坪田博美・武内一恵・上村恭子・山下容富子・吉野由紀夫. 2011. 広島県の帰化植物 2. シャグマハギ. 宮島自然植物実験所ニュースレター 19: 3-4.
  6. 坪田博美・平原友紀・向井誠二. 2011. 広島大学デジタル自然史博物館 http://www.digital-museum.hiroshima-u.ac.jp/~museum/. 宮島自然植物実験所ニュースレター 18: 1.
  7. 井上侑哉・大野彰洋・坪田博美. 2014a. ミヤマハイゴケEurohypnum leptothallum (Müll.Hal.) Ando（ハイゴケ科Hypnaceae）. 宮島自然植物実験所ニュースレター 21: 1.
  8. 井上侑哉・大野彰洋・坪田博美. 2014b. 広島県内のミヤマハイゴケEurohypnum leptothallumについて. 宮島自然植物実験所ニュースレター 21: 2-3.
  9. 坪田博美・井上侑哉・内田慎治・向井誠二. 2014. 宮島でシロイヌナズナが見つかる. 宮島自然植物実験所ニュースレター 21: 3-4.
  10. 坪田博美・正田いずみ・内田慎治・武内一恵・吉野由紀夫・垰田 宏・豊原源太郎・関 太郎. 2014. 植物観察会の記録（2011年6月-2012年3月）. 宮島自然植物実験所ニュースレター 21: 4-13.
  11. 坪田博美. 2014. 宮島の自然－地形と地質および植生と動植物について－. 宮島自然植物実験所ニュースレター 22, 2-5.
  12. 坪田博美・中原-坪田美保・向井美枝子・内田慎治・向井誠二（編）. 2014b. 厳島（宮島）の維管束植物の和名索引（暫定版，2014年11月25日）. 17 pp. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所, 廿日市, 広島.
    1. （旧版）坪田博美・中原-坪田美保・向井美枝子・内田慎治・向井誠二（編）. 2014. 厳島（宮島）の維管束植物の和名索引（暫定版，2014年11月18日）. 15 pp. 広島大学大学院理学研究科附属宮島自然植物実験所, 廿日市, 広島.

雑報・その他

  1. Tsubota, H., T. Arikawa, H. Akiyama, E. De Luna, D. Gonzalez, T. Yamaguchi, M. Higuchi & H. Deguchi. 2001. A preliminary phylogenetic study of hypnalean mosses based on chloroplast rbcL gene sequences. Journal of Plant Research 114, Supplement: 27-28.
  2. 坪田博美・古木達郎・山口富美夫・Haji Mohamed・出口博則. 2001. rbcL遺伝子にもとづくヌエゴケMizutania riccardioidesの分子系統学的位置. 蘚苔類研究 8(2): 52.
  3. 坪田博美. 2002. 蘚類ナガハシゴケ科およびその周辺分類群の分子系統学的研究 Molecular phylogenic study on the Sematophyllaceae (Hypnales, Musci) and their allies. Bunrui 2(1): 32-34.
  4. Tsubota, H. & Deguchi, H. 2004. Molecular phylogenetic relationships of Jungermanniidae based on rbcL sequences, with special reference to Mizutania riccardioides. Bryophylogeny 2004: Second International Symposium on Molecular Systematics
  5. 坪田博美・西山智明. 2005. ミズーリ植物園で開催されたコケ植物の分子情報を用いた系統分類・体系学に関するシンポジウムについて. 蘚苔類研究 9 (1): 32-34.
  6. Sulayman, M., H Tsubota, T Yamaguchi, H Deguchi. 2005. Mosses of Xinjiang Altai Mountains, China. International Bryological Symposium for Prof. Pan-Chieh Chen’s Centennial.
  7. H Tsubota, M Masuzaki, S Mukai, PJ Dalton, H Mohamed, H Deguchi. 2007. A preliminary phylogenetic study on bryophytes based on large-scale dataset of chloroplast rbcL gene sequence. IAB World Conference of Bryology 2007, 19.
  8. 坪田博美. 2008. コケ植物の分子系統学的研究の現状と現在の研究に至るまで. Bunrui 8: 15-27.
  9. 坪田博美. 2009. 広島大学で学んだこと―研究者と教育・社会貢献―. 第9回広島大学大学院理学研究科・理学部教育シンポジウム報告書, 49-52 pp. 広島大学大学院理学研究科・理学部, 東広島.
  10. 定光 淳・嶋村正樹・坪田博美. 2012. 第18回国際植物科学会議メルボルン大会IBC2011に参加して. 蘚苔類研究 10(7): 217-220.

書評

  1. Tsubota, H. 2004. Book Review. "Database for literature relevant to Japanese bryophytes on CD-ROM". The Bryological Times 113: 11-12.

模型・作品

  1. 青山幹男・坪田博美（監修）・西尾製作所（制作）. 2010. 里山の植生遷移模型. 広島大学総合博物館.

学会発表（口頭）

  1. 井上侑哉・坪田博美・山口登美夫. Pachyneuropsis miyagii (Pottiaceae)の系統的位置. 日本蘚苔類学会第41回北海道大会（2012年9月7–9日, 斜里町）. 講演要旨集 9. O5. 蘚苔類研究10: 298–299.

学会発表（ポスター）

  1. 井上侑哉・坪田博美. 愛媛県で見つかったセンボンゴケPottia intermedia (Turner) Furnr.について. 日本植物学会中国四国支部第68回大会（2011年5月14-15日, 高松市）. 講演要旨集 17. BP-26.
  2. 井上侑哉・久保晴盛・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 広島県新産のセンボンウリゴケTimmiella anomala (Bruch & Schimp.) Limpr.について. 日本蘚苔類学会第40回奈良大会（2011年8月9-10日，川上村）. 蘚苔類研究 10: 175-176.
  3. 井上侑哉・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 蘚類センボンウリゴケTimmiella anomalaの日本国内での分布と分子系統学的研究. 日本植物分類学会第11回大阪大会（2012年3月23-25日，吹田市）. 研究発表要旨集 84. P-23.
  4. 井上侑哉・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 広島県宮島の蘚苔類フロラ. 日本植物学会中国四国支部第69回大会（2012年5月12-13日, 松江市）. 講演要旨集 10-11. BP-09.
  5. 内田慎治・井上侑哉・向井誠二・坪田博美. 広島県宮島におけるウエマツソウSciaphila secundiflora Thwaites ex Benth.の発見. 日本植物学会中国四国支部第69回大会（2012年5月12-13日, 松江市）. 講演要旨集 9-10. BP-07.
  6. 内田慎治・井上侑哉・坪田博美. 広島県宮島のTuyamaella molischii (Schiffn.)モーリッシュシゲリゴケについて. 日本蘚苔類学会第41回北海道大会（2012年9月7–9日, 斜里町）. 講演要旨集 20. P8. 蘚苔類研究10: 304.
  7. 井上侑哉・今井丈暁・大西弥真人・鉄川公庸・山本草平・武内一恵・松村雅文・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 広島大学東広島キャンパスの維管束植物. 中国四国植物学会第70回大会（2013年5月11–12日, 徳島）. 講演要旨 5. BP-03.
  8. 泉香菜・久保晴盛・長谷信二・井上侑哉・平原友紀・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 広島県近海におけるウミヒルモ属の分布と実態. 中国四国植物学会第70回大会（2013年5月11–12日, 徳島）. 講演要旨 10. BP-13.
  9. 井上侑哉・内田慎治・坪田博美. 広島県で再発見されたハナシセンボンゴケTortula truncata (Hedw.) Mitt.について. 日本蘚苔類学会第42回岡山大会（2013年8月5–7日, 岡山）. 講演要旨集 27. P-15.
  10. 坪田博美・久保晴盛・井上侑哉・内田慎治・向井誠二. DNAマーカーで見たセン類アカイチイゴケの地理的変異. 日本蘚苔類学会第42回岡山大会（2013年8月5–7日, 岡山）. 講演要旨集 30. P-18.
  11. 坪田博美・島本俊樹・久保晴盛・半田信司・井上侑哉・中原-坪田美保・内田慎治・向井誠二. 大気中から捕捉されたコケ植物. 日本植物学会第77回大会（2013年9月13–15日, 札幌）. プログラム 65. P-011.
  12. 島本俊樹・正田いずみ・久保晴盛・井上侑哉・半田信司・中原－坪田美保・内田慎治・向井誠二・坪田博美. 大気中から補捉された隠花植物とくにコケ植物について. 日本生態学会 PA1-140.
  13. 井上侑哉・坪田博美. セン類センボンウリゴケ属の系統・分類学的位置づけ. 日本植物分類学会第13回大会（2014年3月20‐23日, 熊本）. 研究発表要旨集 57. P23.
  14. 井上侑哉・久保晴盛・坪田博美. 瀬戸内海島嶼部で見つかったイボスジネジクチゴケ（センボンゴケ科，セン類）について. 中国四国植物学会第71回大会（2014年5月10–11日, 岡山）. 講演要旨7, BP-04.
  15. 井上侑哉・佐藤裕幸・坪田博美. 閉鎖果蘚類の系統的位置について. 日本進化学会第16回大会（2014年8月21–24日, 高槻）. 要旨集 151, P47.
  16. 井上侑哉・久保晴盛・坪田博美. イボスジネジクチゴケ（センボンゴケ科，蘚類）の系統・分類学的研究. 日本蘚苔類学会第43回青森大会（2014年8月26–28日）. 講演要旨集 25, P15.

招待講演・セミナー等

  1. 坪田博美. 2006年11月18日（土）. 宮島の植物探訪会. 午前9時～午後3時（雨天決行）. 世界遺産宮島の貴重な植物の観察を行いました．
  2. 坪田博美. 2006年11月23日（祝）. 講演会「宮島の植物研究活動」. 午後1時半～3時. 広島大学宮島自然植物実験所の沿革や研究活動について.
  3. 井上侑哉・坪田博美・嶋村正樹. コケ植物でみられる右巻き・左巻きの形態について. 新学術領域研究「植物発生ロジック」H25年度若手ワークショップ.（2013年11月30日－12月2日，四條畷）. プログラム 3. P-8.

テレビ・ラジオ等

  1. 新にほん風景遺産, 宮島. BS朝日: 2015年10月13日（火）21:00～23:00内の１時間, 広島ホームテレビ: 2015年10月31日（土）13:00-13:55

学会・シンポジウム

一般向け解説・野外観察会

その他

  1. 理学融合. 2014年12月1日（月）

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