- アキニレ Ulmus parvifolia Jacq.［ニレ科 Ulmaceae］ 日・英・中
- アジサイ 日・中
- アベマキ
- アメリカスズカケノキ 中（第2次ネームプレート）
- アメリカハナノキ（確認中）
- アメリカヤマボウシ（ハナミズキ） 中（第2次ネームプレート）
- アラカシ 日・中
- アンズ 中
- イスノキ
- イタヤカエデ 中（編集中）
- イチイガシ 中
- イチジク（確認中）
- イチョウ Ginkgo biloba L. ［イチョウ科 Ginkgoaceae］ 日・英・中
- イヌエンジュ 中（編集中，第3次ネームプレート）
- イヌツゲ
- イヌマキ
- イボタノキ 中
- イロハモミジ 中（第2次ネームプレート）
- ウバメガシ 日・中（第3次ネームプレート）
- ウメ 日・中（第2次ネームプレート）
- ウメモドキ（第2次ネームプレート）
- ウリハダカエデ
- ウワミズザクラ
- エゴノキ 日（第3次ネームプレート）
- エノキ
- エンジュ 日（第2次ネームプレート）
- オオバイボタ
- オオバグミ（確認中，第3次ネームプレート）
- オタフクナンテン
- オリーブ（編集中，第3次ネームプレート）
- カイヅカイブキ
- カイノキ（ランシンボク） 日・中
- カキノキ（編集中，第3次ネームプレート）
- ガクアジサイ
- カクレミノ（編集中，第3次ネームプレート）
- カツラ 日
- カナリーヤシ（フェニックスとして）
- カリン（第2次ネームプレート）
- キャラボク 日（第3次ネームプレート）
- キョウチクトウ（第2次ネームプレート）
- キリ 日（第3次ネームプレート）
- キリシマツツジ
- キンシバイ
- ギンドロ（ウラジロハコヤナギとして）
- キンモクセイ（第2次ネームプレート）
- クスノキ（第2次ネームプレート）
- クチナシ
- クヌギ 日（第2次ネームプレート）
- クリ
- クルメツツジ
- クロガネモチ 日・英
- クロキ（確認中）
- クロマツ
- ゲッケイジュ（第2次ネームプレート）
- ケヤキ Zelkova serrata (Thunb.) Makino［ニレ科 Ulmaceae］ 日・英・中
- コウヨウザン
- コナラ
- コバノミツバツツジ（埋蔵文化財調査部門前に植栽）
- コブシ 日
- ゴヨウマツ 日（第3次ネームプレート）
- ザクロ
- サザンカ（第2次ネームプレート）
- サツキ
- サトウカエデ
- サルスベリ（第2次ネームプレート）
- サンゴジュ
- シダレヤナギ 日（第3次ネームプレート）
- シデコブシ
- シマトネリコ
- シモクレン（第2次ネームプレート）
- シャリンバイ
- シラカシ 日
- シラカンバ（シラカバ） 日（第3次ネームプレート）
- スダジイ
- セイヨウリンゴ（第2次ネームプレート）
- センダン
- ソシンロウバイ 日（第3次ネームプレート）
- ソテツ（編集中，第3次ネームプレート）
- ソメイヨシノ 日
- ソヨゴ（第2次ネームプレート）
- タイサンボク（編集中，第3次ネームプレート）
- タイワンフウ（フウ）（編集中，第3次ネームプレート）
- タギョウショウ（編集中，第3次ネームプレート）
- タブノキ
- ツノハシバミ
- ツブラジイ（コジイ）
- ツルウメモドキ 日（第3次ネームプレート）
- トウカエデ 日（第3次ネームプレート）
- トウグミ
- ドウダンツツジ 日（第3次ネームプレート）
- トウネズミモチ（第2次ネームプレート）
- トキワサンザシ 日
- トキワヤマボウシ（確認中）
- トチノキ（第2次ネームプレート）
- トベラ
- ナツツバキ 日（第3次ネームプレート）
- ナナカマド
- ナワシログミ（編集中，第3次ネームプレート）
- ナンキンハゼ（第2次ネームプレート）
- ナンテン
- ニワウメ
- ヌマスギ（ラクウショウ）（編集中，写真のみ）
- ネズミサシ（ネズ）（編集中，第3次ネームプレート）
- ネズミモチ
- ネムノキ
- ノウゼンカズラ
- ノグルミ（確認中）
- ノルウェーカエデ（確認中）
- ハウチワカエデ（確認中）
- ハクモクレン 日
- ハシバミ（確認中）
- ハナカイドウ 日（第2次ネームプレート）
- ハナゾノツクバネウツギ
- ハマヒサカキ
- ハリエンジュ（第2次ネームプレート）
- ハンノキ（確認中）
- ヒイラギモクセイ（編集中，第3次ネームプレート）
- ヒメユズリハ（編集中，第3次ネームプレート）
- ビヨウヤナギ（編集中）
- ヒラドツツジ
- ビワ
- フイリマサキ（斑入りマサキ）
- フェイジョア（編集中）
- フジ（ノダフジ）
- フヨウ
- ベニカナメモチ
- ホルトノキ（第2次ネームプレート）
- マテバシイ 日
- マルバノキ（ベニマンサク）（第2次ネームプレート）
- ミズナラ（編集中）
- ムクゲ（第2次ネームプレート）
- ムクノキ（編集中，第2次ネームプレート）
- メタセコイア（第2次ネームプレート）
- モチノキ（編集中）
- モッコク（第2次ネームプレート）
- モミ
- モミジバスズカケノキ（確認中，第2次ネームプレート）
- モミジバフウ（アメリカフウ）（第2次ネームプレート）
- ヤツデ（第3次ネームプレート）
- ヤブツバキ（第2次ネームプレート）
- ヤマハンノキ（確認中）
- ヤマボウシ（編集中，第3次ネームプレート）
- ヤマモミジ（編集中，第2次ネームプレート）
- ヤマモモ（第2次ネームプレート）
- ユキヤナギ
- ユリノキ 日（第2次ネームプレート）
- リキュウバイ（編集中，第3次ネームプレート）
- リョウブ（確認中）